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MG-RAST: Metagenomics RAST Server | Argonne National Laboratory

o metagenomics RAST server é um ambiente baseado em sementes que permite aos usuários fazer upload de metagenomas para análises automatizadas. O servidor é construído como uma versão modificada do servidor (Rapid Annotation using Subsystem Technology (RAST). A tecnologia RAST foi originalmente implementada para permitir a anotação automatizada de alta qualidade de genomas microbianos completos ou de rascunho usando dados de sementes e foi adaptada para análise de metagenoma. O servidor fornece a anotação de fragmentos de sequência, sua classificação filogenética, classificação funcional de amostras e comparação entre vários metagenomas. O servidor também calcula uma reconstrução metabólica inicial para o metagenoma e permite a comparação de reconstruções metabólicas de metagenomas e genomas.

Publicações

MG-RAST UM Relatório Técnico e Manual para a Versão 3.3.6

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Usando o Metagenomics RAST Servidor (MG-RAST) para Análise de Espingarda Metagenomes

Análise Metagenomic de Dados: Inferir Comunidade Microbiana Função com MG-RAST