Articles

MGDB: Un database completo di geni coinvolti nel melanoma

Abstract

Il Melanoma Gene Database (MGDB) è un catalogo a cura manuale di dati genetici molecolari relativi ai geni coinvolti nel melanoma. Lo scopo principale di questo database è quello di stabilire una rete di geni correlati al melanoma e di facilitare lo studio meccanicistico della tumorigenesi del melanoma. Le voci che descrivono le relazioni tra melanoma e geni nella versione corrente sono state estratte manualmente da PubMed abstracts, che contiene cumulativi fino ad oggi 527 geni umani del melanoma (422 geni codificanti proteine e 105 geni non codificanti). Ogni gene del melanoma è stato annotato in sette diversi aspetti (Informazioni generali, Espressione, metilazione, mutazione, interazione, percorso e farmaco). Inoltre, sono stati forniti riferimenti alla letteratura curati manualmente per supportare l’inclusione del gene in MGDB e stabilire la sua associazione con il melanoma. MGDB ha un’interfaccia web user-friendly con più funzioni di ricerca e ricerca. Abbiamo sperato MGDB arricchirà le nostre conoscenze sulla genetica del melanoma e servire come un utile complemento alle risorse pubbliche esistenti.