Articles

MG-RAST: Metagenomics Rast szerver / Argonne Nemzeti Laboratórium

a metagenomics Rast szerver egy MAGALAPÚ környezet, amely lehetővé teszi a felhasználók számára, hogy metagenomokat töltsenek fel automatizált elemzésekhez. A kiszolgáló a (Rapid Annotation using Subsystem Technology (Rast) kiszolgáló módosított változataként épül fel. A RAST technológiát eredetileg azért vezették be, hogy lehetővé tegye a teljes vagy vázlatos mikrobiális genomok automatizált, kiváló minőségű annotálását MAGADATOK felhasználásával, és metagenom elemzésre adaptálták. A szerver biztosítja a szekvencia fragmensek annotációját, filogenetikai osztályozását, a minták funkcionális osztályozását, valamint több metagenom összehasonlítását. A szerver kiszámítja a metagenom kezdeti metabolikus rekonstrukcióját is, és lehetővé teszi a metagenomok és a genomok metabolikus rekonstrukcióinak összehasonlítását.

Publications

MG-RAST Technikai jelentés és Kézikönyv A 3.3.6 verzióhoz

az MG-Rast Metagenomikus adatelemzési csővezeték portolása a felhőbe

a Metagenomics Rast Server (MG-RAST) használata a Shotgun Metagenomák elemzéséhez

Metagenomikus adatok elemzése: a Metagenomikus adatok elemzése mikrobiális közösség funkció mg-rast